Joindre l'IPC

04 91 22 33 33

 Prendre rendez-vous

04 91 22 30 30

La plateforme de bioinformatique intégrative : en amont du développement des thérapies ciblées

Intervenant à la frontière entre la médecine et la biologie, l’équipe de la plateforme de bioinformatique intégrative (Cibi) collecte, intègre, croise et analyse des données génomiques et d’expression (ARN, protéines), en tenant compte des connaissances théoriques et des contraintes physico-cliniques. Ces données sont issues de l’expérimentation et d’observations réalisés dans les tumeurs à différents niveaux d’échelle par les équipes de recherche, et sont par définition hétérogènes. D’où l’appellation de plateforme bioinformatique intégrative.

En termes d’offre de services, la plateforme propose aux équipes de l’IPC et du CRCM une large palette de prestations :

  • intégration de données génomiques,
  • développement d’analyses spécifiques,
  • son système de gestion d’information,
  • développement de pipelines bioinformatiques.

Son expertise est particulièrement reconnue en algorithmique, intégration de données biologiques à haut débit, analyse et visualisation de données génomiques.

Des techniques qui, grâce aux nouvelles informations ainsi générées, ont par exemple permis ces dernières années de mettre en évidence des signatures moléculaires de différentes tumeurs, notamment d’identifier et de caractériser des sous-types dans le cancer du sein. Actuellement, plusieurs projets portant sur l’analyse de réseaux d’interactions dans le cancer du sein et dans le cancer du pancréas sont en cours d’étude par l’équipe, dirigée par Ghislain Bidaut.

Responsable et contact

Dr Ghislain Bidaut

Équipe de la plateforme de bioinformatique intégrative

En savoir plus sur cette plateforme :